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칼로리사전

Wed, 12 Nov 2008 09:40:43 +0900

양상추 100g : 50kcal

식빵 한조각 : 100kcal

샤니 버터롤 : 3개 220kcal

콩국수 : 500kcal

우리나라의 카페인 1일 허용량은 단위 체중(kg) 당 2.5mg. 초등 4학년의 평균 체중(35kg)을 적용하면 하루 허용량은 87.5mg이다. 미국의 어린이단체인 네머스재단은 체중에 관계없이 어린이들의 카페인 섭취가 하루 100mg을 넘지 않아야 한다고 권고하고 있다.

63 * 2.5 = 157.5mg

또, 단지 커피만이 카페인이 많다고 규정하는 것도 무리한 가설이다. 식약청에서 조사한 바에 따르면 커피 한 잔에 들어가는 양은 100㎎, 녹차 한 잔은 50㎎, 초콜릿 바 100g에 80㎎정도가 들어간다.

이런 가운데 지난 27일 식품의약품안전청은 하루에 섭취할 카페인 권장량을 제시했다. 이에 따르면 커피믹스(12g)에는 평균 69mg, 캔커피 1캔(175㎖) 74mg, 콜라 1캔(355㎖) 34mg,녹차 1티백 15mg 정도의 카페인이 들어있다.

http://www.energyfiend.com/the-caffeine-database

식품의 카페인 함량에 대한 데이터 베이스 중 하나입니다.

이 자료에 따르면
인스턴트 커피 약 230cc(8oz) 에 57mg 의 카페인
에스프레소 커피 약 40cc(1.5oz) 에 77mg 의 카페인
드립커피 약 230cc(8oz) 에 145mg 의 카페인
이 함유되어 있다고 합니다.(상황에 따라서 다소 차이는 있지만, 평균적인 수치입니다.)

'드립 커피 > 에스프레소 > 인스턴트 커피' 순으로 카페인이 많이 함유되어 있다고 하네요.

필립 퍼키스의 사진강의 노트

Mon, 27 Oct 2008 22:06:11 +0900

책

필립 퍼키스의 사진강의 노트 : 사진과 삶에 관한 단상

Teaching Photography

필립 퍼키스, Philip Perkis

박태희 옮김

눈빛

사진을 어떻게 찍을 것인가 HOW TO TAKE A PICTURE

보여지는 것, 그 자체. 너무 성급하게 메타포나 상징으로 건너뛰지마라. '문화적 의미'를 담으려 하지 마라. 아직 이르다. 이런 것들은 나중에 생각해도 늦지 않다. 먼저 대상의 표면에 떨어진 빛의 실체를 느껴야 한다.

의미는 없다. 오로지 사물만이 존재할 뿐이다.

- 윌리엄스 W. C. Williams

사진이 찍혀지는 순간까지 그것과 함께 머물러야 한다. 그러나 삶 전체를 통틀어 내가 배운 모든 것들은 이 머무름과 반대 선상에 있었다.

있는 그대로 본다는 것 : 빛, 공간, 거리 사이의 관게, 공기, 울림, 리듬, 질감, 운동의 형태, 명암, …사물 그 자체… 이들이 나중에 무엇을 의미하든 아직은 사회적이지도, 정치적이지도, 성적이지도 않다.

이름을 주지도, 상표를 붙이지도, 재 보지도, 좋아하지도, 증오하지도, 기억하지도, 탐하지도 마라. 그저 바라만 보아라.

이것이 가장 힘든 일이다. 그러나 그저 보이는 게 찍힐 뿐이다. 카메라는 파인더 안에 보이는 사물의 표면에 반사된 빛을 기록할 뿐이다. 그것이 전부다.

그것의 의미를 경험한다는 것. 몇 초에 불과하더라도 그것을 그저 바라만 보며 그 존재를 느낀다는 것은 쉬운 일이 아니다. 언어가 배제된 목소리, 음악의 선율, 도자기, 추상화. 그것의 현존, 그것의 무게, 그것의 존재와 나의 존재의 경이로움. 사실 그 자체의 신비.

아마도 사진을 찍는다는 것은 남은 길이의 반만큼을 끊임없이 가고 또 가야 되는 제논의 역설과 같다. 영원을 향한 노정의 절반에 도달했을 때 남은 거리를 뛰어넘기 위해서는 하늘의 은총이 필요하다.

그 틈새를 건너뛰게 도와줄 무언가를 희망하며 나는 계속 사진을 찍는다.

사진과 시 PHOTOGRAPHY AND POETRY

음악에 대해서 말하자면, 레너드 번스타인Leonard Bernstein이 음악 자체보다 그 내용에 대하여 더 강조함으로써 음악에 대한 이해의 폭을 50년 뒤로 쳐지게 만들어 놓았다는 것이 내 견해다. 1950년대 초반에 열린 「젊은이들을 위한 음악회」에서 그는 어린이들에게 베토벤의 <5번교향곡>을 들을 때는 말을 탄 사나이들이 돌격하는 장면을 상상하라고 말했다. '무엇'을 상상하려고 하면 우리는 그 말의 족쇄에 걸려 그 '무엇'밖에는 상상할 수 없게 된다.

사실 이 문제는 매우 까다롭다. 사진이 가장 표현하기 힘든 매체 가운데 하나인 까닭은 시각 매체로서 사진이 독특하고 강렬한 묘사의 특성을 가진 동시에 바로 이 특성 때문에 사진의 내용은 객관적 사실로 보인다는 점이다. 이 점이 바로 사진의 역설이다.

사진, 서구문명 몰락의 원인 PHOTOGRAPHY AS THE CAUSE OF THE DOWNFALL OF WESTERN CIVILIZATION

아버스는 평범한 사람들은 현실과는 동떨어진 이방인처럼 찍어내는데 능력이 있었다. 아마도 우리는 자기 안에 내재된 감정을 투영하고 반추하기 위해 사진을 찍는지도 모른다(스티글리츠Alfred Stieglitz의 '이퀴벌런스Equivalence를 이해하는 또다른 방식인가?).

나는 전시장 주위를 어슬렁거리며 몇 시간을 보냈다. 왜냐하면 떠들썩한 전시회의 명성에 비해 작품들 자체가 심오하거나 대단하다고는 도무지 느낄 수 없었기 때문이다. 도대체 왜 이토록 많은 사람들이 열광하는지 알고 싶엇다.

관람객의 대부분은 보통사람들이었다. '전위적인' 사람들이 아니었다. 물론 '아웃사이더'들도 거의 없었다. "세상에, 내가 저 사진 속의 사람들을 직접 만나지 않게 되어 얼마나 다행인지 몰라." 전시회를 다시 보러 갈 때마다 이런 종류의 말을 적어도 수십번은 들엇다.

나는 천천히 깨닫게 되엇다. 사진은 우리가 두려워하거나 직접 부딪치기 싫어하는 것을 내다볼 수 있는 창문 역할을 하는 것이다.

보는 방법 HOW TO LOOK

한 '영역'을 한꺼번에 전부 볼 수 있도록 눈의 근육을 풀고 뒤로 물러나 앉는다. 여기저기로 눈길을 돌리지 않는다. 매우 엄격한 노력을 요구하지만 사진 찍는 연습으로 이보다 더 좋은 훈련은 없다.

나는 사진을 찍을 때 '전체'를 포착하도록 노력한다. 셔터를 누르는 순간 나의 직관과 본능을 신뢰하지 않고 전체를 포착한다는 건 불가능하다. 그저 생각만으로 되는 일이 아니다.

늘 같은 렌즈를 쓰는 것이 바람직하다. 렌즈가 제공하는 시야에 익숙해지면 '전체'를 훨씬 빨리 포착할 수 있기 때문이다.

줌렌즈야말로 악마의 작품이다. 줌렌즈는 대상을 날카롭게 잡아내는 경우가 드물며, 더 중요한 이유는, 사진가의 진정한 '시각'을 구축하는 데 아무런 도움이 되지 않기 때문이다.

프레임은 사진가가 조작한 시각이지 결코 자연스러운 것이 아니다. 그런 점에서 본다면 프레임이 사진 내용에 가장 큰 영향을 미친다는 사실은 대단히 역설적이다.

의도 INTENTION

나는 사진을 찍기 위해 어떤 재료(카메라, 렌즈, 필름)를 가지고 어떤 시간에 어떤 장소로 간다. 그곳은 우리 집 뒷마당일 수도 있고 거실일 수도 있다. 꼭 저 광활한 몽고사막일 필요는 없다. 이제 나는 어떤 일이 벌어질지 지켜볼 것이다. 그리고 내 몸과 마음은 예민한 레이더가 되어 모든 상황에 적극 반응할 것이다. 대신 내용이나 의도는 고려하지 않도록 최대한 노력할 것이다. 이 상황에 완전히 몰입한 상태에서, 나는 약간의 행운(은총)과 더불어 내 의도가 사진 찍는 행위와 일치될 수 있는 '열린' 상태를 맞게 된다.

이런 태도가 미리 계획하는 것보다 덜 의도적이라고는 할 수 없다. 오히려 더 의도적일 수 있다. 구체적인 계획이 없으면, 내 안에 잠재된 것들까지 끌어내 더욱 역동적으로 상황에 대처하기 때문이다. 그러므로 미리 계획을 철저하게 세우고 일을 진행시키는 것보다 대략적인 계획 아래 구체적인 부분들을 자신의 본능, 직관, 감각에 따라 유연하게 대처한다면 오히려 더 좋은 결과를 얻을 수 있다.

풍경 LANDSCAPE

풍경사진에서는 '거리 사진'처럼 앞에 가던 사람이 갑자기 고개를 돌린다거나 모자가 휙 날라 가는 것 같은 기이하고 경이로운 돌발사태는 일어나지 않는다.

또한 '거리 사진'의 내용들은 적어도 얼마간 비평적인 시각이나 아이러니한 느낌을 담고 있다. 이는 사진가가 관찰자로서 프레임을 선택하거나 노출 시간을 조정하여 내용을 선택하고 변화시킬 수 있는 우월한 위치에 있기에 가능한 일이다. 그리고 거리에서 사람들을 찍는 것은 어느 정도 긴장감과 흥분을 일으키며, 그래서 그 감정들이 고스란히 사진에 묻어난다.

§ § §

그때까지 나는 진흙탕물 속에서 무언가를 부여잡으려 안간힘을 쓰며 허우적대고 있었다. 사진은 말보다 앞선다.

...중략...

천천히 나는 자연이란 비평의 대상이 아니며, 우리가 자연 속에서 느끼는 경외감은 빛, 공간, 질감 그리고 공기의 울림과 관련이 있고, 자연이란 한 번도 같은 적이 없었다는 놀라운 발견에 눈을 뜨게 되었다. 행운이란 순간적으로 바위에 드리워진 나뭇가지의 그림자 같은 것이다.

빛이 반짝거리는 웅덩이에 둥둥 떠다니는 나뭇잎이 중요한 사건이 될 수 있음을 나는 마침내 진정으로 이해하게 되었다. 아이의 눈으로 세상을 바라보자 사물들간의 위계질서도 점점 희미해져 갔다. 세상에 존재하는 모든 것은 똑같은 가치를 지니고 있었고, '내용'은 그 모습과 기능 안에 녹아 있었다.

다시 풍경사진으로 돌아가 보자. 만약 사진가인 내가 풍경화의 역사를 심사숙고한 다음, 카메라를 써서 내가 연구한 풍경화 같은 사진을 갈고리로 낚아채듯 '찍어낸다면', 결과는 이도 저도 아닌 어정쩡한 사진이 될 것이다. 한 술 더 떠, 인화할 때 장엄한 느낌을 '양념으로 곁들이면', 그야말로 결과는 엉망진창이 된다. 어느 누구도 자연을 개선할 수 없다.

저 자연속에 존재하는 변화무쌍한 공간, 울림, 빛, 공기, 움직임, 삶과 죽음에 조응하기 위해 내가 할 수 있는 일은 밖으로 나가서 내 '자신'을 찾는 것이다.

디지털 사진에 대한 재고 DIGITAL REVISITED

새로운 기술을 사용하지 말라는 얘기가 아니다. 다만 그것이 최신 기술이고 일을 쉽고 빠르게 처리한다고 해서 거기에만 푹 빠져 매몰되지 말고 그저 도구로만 사용하라는 것이다.

니오타니 NEOTENY

겨울 하늘을 가르는, 헐벗은 나뭇가지를 스치며 날아가는 새를 경이롭게 바라보는 이 순간, 나는 감사의 기도를 드린다.

LoadLeveler

Mon, 27 Oct 2008 11:10:20 +0900

LoadLeveler

CentOS 5.2(x86)가 설치된 상태에서 시작하겠습니다.

사이트 http://www.loadl.com (새 창으로 열기) 에서 프로그램 소스를 다운 받아 압축을 풉니다.
무료버젼은 아직 제약사항이 많습니다. 다음의 기능은 무료버젼에서 제공하지 않습니다.

Preemption
Web UI
Scheduling affinity
Enforced consumable resources with WLM
Parallel Checkpoint/restart
Blue Gene support
Move Spool for Schedd recovery

압축이 풀리면 경로 src/ll로 이동합니다. README를 읽어보면 아주 간단하게 설명이 적혀 있습니다. 개략적인 설치과정은 다음과 같습니다.

#autoheader;aclocal;autoconf;automake
#./configure
# make all
# make install
# make rpm

설명대로 해봅니다.

autoheader;aclocal;autoconf;automake
# ./configure
# autoheader;aclocal;autoconf;automake
# ./configure

약간의 시간이 걸린 후, 늘상 되던대로 configure 작업이 진행됩니다. 오류하나 없이 잘 지나간 것 같지만 그렇지 않습니다. 결과화면을 잘 살펴봅니다.

---------> host = Linux gs002 2.6.18-92.1.10.el5 #1 SMP Tue Aug 5 07:41:53 EDT 2008 i686 i686 i386 GNU/Linux
---------> test64 = 0
---------> with_64bit_lib =
---------> CONTEXT = unknown
---------> ARCH = i386
---------> CPU = x86
---------> OPSYS = unknown
---------> with_rsct =
---------> with_ctsec =
---------> with_kbdd = yes
---------> CCFLAGS = -fpermissive -D_REENTRANT -D_LIBC_REENTRANT -Wno-deprecated -DLINUX -c -g -DLL_LINUX_CKPT -Dunknown -D__GDBM_COMPAT__ -D__FUNCTION__=__PRETTY_FUNCTION__
---------> host = Linux gs002 2.6.18-92.1.10.el5 #1 SMP Tue Aug 5 07:41:53 EDT 2008 i686 i686 i386 GNU/Linux
---------> test64 = 0
---------> with_64bit_lib =
---------> CONTEXT = unknown
---------> ARCH = i386
---------> CPU = x86
---------> OPSYS = unknown
---------> with_rsct =
---------> with_ctsec =
---------> with_kbdd = yes
---------> CCFLAGS = -fpermissive -D_REENTRANT -D_LIBC_REENTRANT -Wno-deprecated -DLINUX -c -g -DLL_LINUX_CKPT -Dunknown -D__GDBM_COMPAT__ -D__FUNCTION__=__PRETTY_FUNCTION__

자세히보니 CONTEXT와 OPSYS가 unknown으로 잡혀 있습니다. 혹시나 될까 싶어 make를 실행해도 오류만 나고 제대로 작동하지 않습니다.
configure소스를 살펴보니 RHEL또는 SLES외에는 검출하지 못합니다. 약간 소스를 수정합니다.

# vi configure
        RHEL=`grep "Red Hat Enterprise Linux" /etc/issue | wc -l`
        SLES=`grep "SUSE Linux Enterprise" /etc/issue | wc -l`
        CENT=`grep "CentOS" /etc/issue | wc -l`
        if test "$RHEL" = 1; then
             CONTEXT=rhel
        elif test "$SLES" = 1; then
             CONTEXT=sles
        elif test "$CENT" = 1; ten
             CONTEXT=rhel
        fi
        RHEL=`grep "Red Hat Enterprise Linux" /etc/issue | wc -l`
        SLES=`grep "SUSE Linux Enterprise" /etc/issue | wc -l`
        CENT=`grep "CentOS" /etc/issue | wc -l`
        if test "$RHEL" = 1; then
             CONTEXT=rhel
        elif test "$SLES" = 1; then
             CONTEXT=sles
        elif test "$CENT" = 1; ten
             CONTEXT=rhel
        fi

다시 configure 작업을 해줍니다.

# ./configure
---------> CONTEXT = rhel
...
---------> OPSYS = rhel5

레드햇으로 잘 잡혔습니다.
이어서 make작업을 계속 해줍니다.

# make all
# make rpm

문제없이 다음 경로에 rpm이 생성이 되면 성공입니다.
/usr/src/redhat/RPMS/i386/LoadL-free-Linux-1.0-0.i386.rpm

README에 있던 make install은 설치과정인데, 사실 후에 rpm으로 설치를 할 생각이므로 지금 설치할 필요는 없을 것 같습니다. install을 하면 /opt 아래에 프로그램이 설치가됩니다.

rpm 설치를 완료하고나면, 자잘한 세팅을 해야합니다. 사실 매뉴얼대로라면 llinit이라는 스크립트가 존재하는 것 같은데, 아무리봐도 없는 것을 보면 소스 공개하면서 빠졌나봅니다. 다행이도 매뉴얼에 llinit가 하는 일들을 잘 적어놔서 그것을 보고 설치를 할 수 있습니다.

설치하기전에 간단히 디렉토리를 정하고 넘어가겠습니다.

Local directory : /var/loadl
Home directory : /home/loadl
Release directory : /opt/ibmll/LoadL/full

진행은 root로 진행합니다.

$ su - root

LoadLeveler가 동작할 유저와 그룹 계정을 추가하여야 합니다. 유저 이름과 그룹 이름은 매뉴얼에 나온대로 둘다 loadl로 하겠습니다.

groupadd -g loadl_group_id loadl
# useradd -d /home/loadl -s /bin/bash -u loadl_user_id -g loadl_group_id -m loadl

여기서 loadl_group_id, loadl_user_id는 유저, 그룹 고유 아이디로 동일값을 넣어주셔야 합니다.

이제 rpm을 설치합니다. 일단 설치과정은 root로 진행합니다.

# rpm -Uvh LoadL-free-linux-1.0-0.i386.rpm

앞에서 말한대로 llinit의 과정을 손으로 해줄 차례입니다.

진행은 방금 만든 loadl로 진행합니다.

su - loadl

프로그램이 설치된 곳(/opt/ibmll/LoadL/full)의 samples 디렉토리에 보면 LoadL_admin, LoadL_config파일이 있습니다. 이 두 파일을 /home/loadl로 복사합니다.

다음 디렉토리를 생성합니다. 괄호안은 퍼미션입니다.

/var/loadl/spool (700)
/var/loadl/execute (1777)
/var/loadl/log (775)
프로그램이 설치된 곳(/opt/ibmll/LoadL/full) samples 디렉토리에 LoadL_config.local 을 /var/loadl에 복사합니다.

ln -s 명령으로 심볼릭링크를 생성합니다.
/home/loadl/spool <- /var/loadl/spool
/home/loadl/execute <- /var/loadl/execute
/home/loadl/log <- /var/loadl/log
/home/loadl/LoadL_config.local <- /var/loadl/LoadL_config.local
/home/load/bin <- /opt/ibmll/LoadL/full/bin
/home/load/lib <- /opt/ibmll/LoadL/full/lib
/home/load/man <- /opt/ibmll/LoadL/full/man
/home/load/samples <- /opt/ibmll/LoadL/full/samples
/home/load/include <- /opt/ibmll/LoadL/full/include

PATH를 추가합니다.
/opt/ibmll/LoadL/full/bin 이나 /home/loadl/bin 둘중 하나를 추가합니다.

각 클러스터 노드에 대해서 이를 동일하게 적용합니다. 각 config파일은 일치해야합니다.

이것으로 설치는 완료되었습니다.

DNA_snaps_with_solvent

Thu, 23 Oct 2008 16:22:33 +0900

필요한 라이브러리 준비#
1. CLAPACK
2. ATLAS
  1. configure
  2. make
3. f2c
프로그램 설치

필요한 라이브러리 준비^#

필요한 라이브러리 ;

CLAPACK
ATLAS
libf2c

라이브러리들은 모두 static으로 컴파일하여 이용한다.

CLAPACK^#

make 환경 파일을 복사^#

[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$ cp make.inc.example make.inc

make f2c^#

[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$ make f2clib
...(중략)...
gcc -c -DSkip_f2c_Undefs -O3 dtime_.c
ld -r -x -o dtime_.xxx dtime_.o
mv dtime_.xxx dtime_.o
gcc -c -DSkip_f2c_Undefs -O3 etime_.c
ld -r -x -o etime_.xxx etime_.o
mv etime_.xxx etime_.o
ar r libf2c.a f77vers.o i77vers.o main.o s_rnge.o abort_.o exit_.o getarg_.o iargc_.o getenv_.o signal_.o s_stop.o s_paus.o system_.o cabs.o derf_.o derfc_.o erf_.o erfc_.o sig_die.o uninit.o pow_ci.o pow_dd.o pow_di.o pow_hh.o pow_ii.o pow_ri.o pow_zi.o pow_zz.o c_abs.o c_cos.o c_div.o c_exp.o c_log.o c_sin.o c_sqrt.o z_abs.o z_cos.o z_div.o z_exp.o z_log.o z_sin.o z_sqrt.o r_abs.o r_acos.o r_asin.o r_atan.o r_atn2.o r_cnjg.o r_cos.o r_cosh.o r_dim.o r_exp.o r_imag.o r_int.o r_lg10.o r_log.o r_mod.o r_nint.o r_sign.o r_sin.o r_sinh.o r_sqrt.o r_tan.o r_tanh.o d_abs.o d_acos.o d_asin.o d_atan.o d_atn2.o d_cnjg.o d_cos.o d_cosh.o d_dim.o d_exp.o d_imag.o d_int.o d_lg10.o d_log.o d_mod.o d_nint.o d_prod.o d_sign.o d_sin.o d_sinh.o d_sqrt.o d_tan.o d_tanh.o i_abs.o i_dim.o i_dnnt.o i_indx.o i_len.o i_mod.o i_nint.o i_sign.o lbitbits.o lbitshft.o h_abs.o h_dim.o h_dnnt.o h_indx.o h_len.o h_mod.o h_nint.o h_sign.o l_ge.o l_gt.o l_le.o l_lt.o hl_ge.o hl_gt.o hl_le.o hl_lt.o ef1asc_.o ef1cmc_.o f77_aloc.o s_cat.o s_cmp.o s_copy.o backspac.o close.o dfe.o dolio.o due.o endfile.o err.o fmt.o fmtlib.o ftell_.o iio.o ilnw.o inquire.o lread.o lwrite.o open.o rdfmt.o rewind.o rsfe.o rsli.o rsne.o sfe.o sue.o typesize.o uio.o util.o wref.o wrtfmt.o wsfe.o wsle.o wsne.o xwsne.o dtime_.o etime_.o
ar: creating libf2c.a
ranlib libf2c.a
mv libf2c.a ..
make[1]: Leaving directory `/home/test/CLAPACK-3.1.1.1/F2CLIBS/libf2c'
[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$

make blas^#

[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$ make blaslib
...(중략)...
gcc -O3 -c lsame.c -o lsame.o
gcc -O3 -c xerbla.c -o xerbla.o
ar cr ../../blas_LINUX.a isamax.o sasum.o saxpy.o scopy.o sdot.o snrm2.o srot.o srotg.o sscal.o sswap.o sdsdot.o srotmg.o srotm.o sgemv.o sgbmv.o ssymv.o ssbmv.o sspmv.o strmv.o stbmv.o stpmv.o strsv.o stbsv.o stpsv.o sger.o ssyr.o sspr.o ssyr2.o sspr2.o sgemm.o ssymm.o ssyrk.o ssyr2k.o strmm.o strsm.o idamax.o dasum.o daxpy.o dcopy.o ddot.o dnrm2.o drot.o drotg.o dscal.o dswap.o drotmg.o drotm.o dgemv.o dgbmv.o dsymv.o dsbmv.o dspmv.o dtrmv.o dtbmv.o dtpmv.o dtrsv.o dtbsv.o dtpsv.o dger.o dsyr.o dspr.o dsyr2.o dspr2.o dgemm.o dsymm.o dsyrk.o dsyr2k.o dtrmm.o dtrsm.o scabs1.o scasum.o scnrm2.o icamax.o caxpy.o ccopy.o cdotc.o cdotu.o csscal.o crotg.o cscal.o cswap.o csrot.o isamax.o sasum.o saxpy.o scopy.o snrm2.o sscal.o cgemv.o cgbmv.o chemv.o chbmv.o chpmv.o ctrmv.o ctbmv.o ctpmv.o ctrsv.o ctbsv.o ctpsv.o cgerc.o cgeru.o cher.o chpr.o cher2.o chpr2.o cgemm.o csymm.o csyrk.o csyr2k.o ctrmm.o ctrsm.o chemm.o cherk.o cher2k.o dcabs1.o dzasum.o dznrm2.o izamax.o zaxpy.o zcopy.o zdotc.o zdotu.o zdscal.o zrotg.o zscal.o zswap.o zdrot.o idamax.o dasum.o daxpy.o dcopy.o dnrm2.o dscal.o zgemv.o zgbmv.o zhemv.o zhbmv.o zhpmv.o ztrmv.o ztbmv.o ztpmv.o ztrsv.o ztbsv.o ztpsv.o zgerc.o zgeru.o zher.o zhpr.o zher2.o zhpr2.o zgemm.o zsymm.o zsyrk.o zsyr2k.o ztrmm.o ztrsm.o zhemm.o zherk.o zher2k.o lsame.o xerbla.o
ranlib ../../blas_LINUX.a
make[1]: Leaving directory `/home/test/CLAPACK-3.1.1.1/BLAS/SRC'
[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$

blas test^#

[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$ cd BLAS/TESTING/
[test@tesla TESTING]$ make -f Makeblat2
gcc -O3 -c sblat2.c
gcc    sblat2.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat2s
gcc -O3 -c dblat2.c
gcc    dblat2.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat2d
gcc -O3 -c cblat2.c
gcc    cblat2.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat2c
gcc -O3 -c zblat2.c
gcc    zblat2.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat2z
[test@tesla TESTING]$ cd ..
[test@tesla BLAS]$ ./xblat2s < sblat2.in
[test@tesla BLAS]$ ./xblat2d < dblat2.in
[test@tesla BLAS]$ ./xblat2c < cblat2.in
[test@tesla BLAS]$ ./xblat2z < zblat2.in
[test@tesla BLAS]$ cd TESTING
[test@tesla TESTING]$ make -f Makeblat3
gcc -O3 -c sblat3.c
gcc    sblat3.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat3s
gcc -O3 -c dblat3.c
gcc    dblat3.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat3d
gcc -O3 -c cblat3.c
gcc    cblat3.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat3c
gcc -O3 -c zblat3.c
gcc    zblat3.o \
        ../../blas_LINUX.a ../../F2CLIBS/libf2c.a -lm -o ../xblat3z
[test@tesla TESTING]$ cd ..
[test@tesla BLAS]$ ./xblat3s < sblat3.in
[test@tesla BLAS]$ ./xblat3d < dblat3.in
[test@tesla BLAS]$ ./xblat3c < cblat3.in
[test@tesla BLAS]$ ./xblat3z < zblat3.in

*.out 파일을 살펴본다.

make CLAPACK^#

[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$ make
...(중략)...
make[1]: Leaving directory `/home/test/CLAPACK-3.1.1.1/BLAS/TESTING'
( cd BLAS; ./xblat3s < sblat3.in ; \
                   ./xblat3d < dblat3.in ; \
                   ./xblat3c < cblat3.in ; \
                   ./xblat3z < zblat3.in )
[test@tesla CLAPACK-3.1.1.1]$

lapack_LINUX.a, blas_LINUX.a파일이 생성이 되었으면 제대로 설치되었음.

ATLAS^#

설치할 폴더를 미리 만들고 그 안에서 작업을 시작한다.

configure^#

[test@tesla ~]$ mkdir ATLAS
[test@tesla ~]$ cd ATLAS
[test@tesla ATLAS]$ ../atlas3.8.2/configure
...(중략)...
cp /home/test/ATLAS/../atlas3.8.2//makes/Make.l3 src/blas/level3/Makefile
cp /home/test/ATLAS/../atlas3.8.2//makes/Make.l3aux src/blas/level3/rblas/Makefile
cp /home/test/ATLAS/../atlas3.8.2//makes/Make.l3kern src/blas/level3/kernel/Makefile
cp /home/test/ATLAS/../atlas3.8.2//makes/atlas_trsmNB.h include/.
cp /home/test/ATLAS/../atlas3.8.2//CONFIG/ARCHS/Makefile ARCHS/.
make[2]: Leaving directory `/home/test/ATLAS'
make[1]: Leaving directory `/home/test/ATLAS'
DONE configure
[test@tesla ATLAS]$

make^#

[test@tesla ATLAS]$ make
...(중략)...
ATL_F77wrap_zptgemm.o ATL_F77wrap_zpthemm.o ATL_F77wrap_zpther2k.o ATL_F77wrap_zptherk.o ATL_F77wrap_zptsymm.o ATL_F77wrap_zptsyr2k.o ATL_F77wrap_zptsyrk.o ATL_F77wrap_zpttrmm.o ATL_F77wrap_zpttrsm.o dcabs1.o lsame.o xerbla.o
echo /home/test/ATLAS/lib/libptf77blas.a
/home/test/ATLAS/lib/libptf77blas.a
touch zptlvl3.grd
make[4]: Leaving directory `/home/test/ATLAS/interfaces/blas/F77/src'
make[3]: Leaving directory `/home/test/ATLAS/interfaces/blas/F77/src'
make[2]: Leaving directory `/home/test/ATLAS/bin'
ATLAS install complete. Examine
ATLAS/bin/<arch>/INSTALL_LOG/SUMMARY.LOG for details.
make[1]: Leaving directory `/home/test/ATLAS'
make clean
make[1]: Entering directory `/home/test/ATLAS'
rm -f *.o x* config?.out *core*
make[1]: Leaving directory `/home/test/ATLAS'
[test@tesla ATLAS]$

lib 디렉토리에 *.a 파일이 생겼는지 확인한다.

f2c^#

[test@tesla f2c]$ cp makefile.u makefile
[test@tesla f2c]$ make hadd
cat f2c.h0 f2ch.add >f2c.h
[test@tesla f2c]$ make
...(중략)...
mv etime_.xxx etime_.o
ar r libf2c.a f77vers.o i77vers.o main.o s_rnge.o abort_.o exit_.o getarg_.o iargc_.o getenv_.o signal_.o s_stop.o s_paus.o system_.o cabs.o ctype.o derf_.o derfc_.o erf_.o erfc_.o sig_die.o uninit.o pow_ci.o pow_dd.o pow_di.o pow_hh.o pow_ii.o pow_ri.o pow_zi.o pow_zz.o c_abs.o c_cos.o c_div.o c_exp.o c_log.o c_sin.o c_sqrt.o z_abs.o z_cos.o z_div.o z_exp.o z_log.o z_sin.o z_sqrt.o r_abs.o r_acos.o r_asin.o r_atan.o r_atn2.o r_cnjg.o r_cos.o r_cosh.o r_dim.o r_exp.o r_imag.o r_int.o r_lg10.o r_log.o r_mod.o r_nint.o r_sign.o r_sin.o r_sinh.o r_sqrt.o r_tan.o r_tanh.o d_abs.o d_acos.o d_asin.o d_atan.o d_atn2.o d_cnjg.o d_cos.o d_cosh.o d_dim.o d_exp.o d_imag.o d_int.o d_lg10.o d_log.o d_mod.o d_nint.o d_prod.o d_sign.o d_sin.o d_sinh.o d_sqrt.o d_tan.o d_tanh.o i_abs.o i_dim.o i_dnnt.o i_indx.o i_len.o i_mod.o i_nint.o i_sign.o lbitbits.o lbitshft.o h_abs.o h_dim.o h_dnnt.o h_indx.o h_len.o h_mod.o h_nint.o h_sign.o l_ge.o l_gt.o l_le.o l_lt.o hl_ge.o hl_gt.o hl_le.o hl_lt.o ef1asc_.o ef1cmc_.o f77_aloc.o s_cat.o s_cmp.o s_copy.o backspac.o close.o dfe.o dolio.o due.o endfile.o err.o fmt.o fmtlib.o ftell_.o iio.o ilnw.o inquire.o lread.o lwrite.o open.o rdfmt.o rewind.o rsfe.o rsli.o rsne.o sfe.o sue.o typesize.o uio.o util.o wref.o wrtfmt.o wsfe.o wsle.o wsne.o xwsne.o dtime_.o etime_.o
ar: creating libf2c.a
ranlib libf2c.a
[test@tesla f2c]$

프로그램 설치^#

프로그램의 소스코드의 압축을 푼다.

[test@tesla ~]$ tar zxvpf DNA_snaps_with_solvent.tgz
DNA_snaps_with_solvent/
DNA_snaps_with_solvent/.DS_Store
DNA_snaps_with_solvent/.gdb_history
DNA_snaps_with_solvent/0README
DNA_snaps_with_solvent/babt_W_3.6500.pdb
DNA_snaps_with_solvent/babt_WOUT_3.6500.pdb
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/0README
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/condu_inelast.log_example
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/InelasticTransmission.c
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/snapshot_1.out_example
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/snapshot_1.pdb_example
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/snapshot_1.xyz_example
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/tsavgol.c
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_EXAMPLE/tsavgol.lst_example
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_WOUT/
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_WOUT/snapshot_1.out
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_WOUT/snapshot_1.pdb
DNA_snaps_with_solvent/BPR_SNAPSHOTS_WOUT/snapshot_1.xyz
DNA_snaps_with_solvent/DNA_solvent_snapshot_processing.c
DNA_snaps_with_solvent/f2c.h
DNA_snaps_with_solvent/MolecTransportLB_einmaligCTtriangle.c
DNA_snaps_with_solvent/nohup.out_example
DNA_snaps_with_solvent/parameters
DNA_snaps_with_solvent/Proposal_KIST_KIT.doc
[test@tesla ~]$

추가적으로 AMD용 코드가 필요하다면 AMD용 패치코드를 설치한다.

[test@tesla DNA_snaps_with_solvent]$ tar zxvpf ../DNA_snaps_with_solvent_for_AMD.tgz
Vacker1opt_S.pdb
Vacker1opt_S_PROBA.out
Vacker2opt_S.pdb
Vacker2opt_S_PROBA.out
MolecTransportLB_einmaligCTtriangle.c
[test@tesla DNA_snaps_with_solvent]$

컴파일 작업을 한다.

작업시 라이브러리 경로는 다음과 같다. ;

CLAPACK : ../CLAPACK-3.1.1.1/lapack_LINUX.a
BLAS : ../CLAPACK-3.1.1.1/blas_LINUX.a
ATLAS : ../ATLAS/lib/*.a
f2c : ../f2c/libf2c.a

gcc -O6 -fomit-frame-pointer -funroll-all-loops -ffast-math -o MolTrans.x MolecTransportLB_einmaligCTtriangle.c ../CLAPACK-3.1.1.1/lapack_LINUX.a ../CLAPACK-3.1.1.1/blas_LINUX.a -L../ATLAS/lib -llapack -lcblas -lf77blas -latlas ../f2c/libf2c.a -lm

컴파일 작업 완료.

GFS

Mon, 06 Oct 2008 11:55:13 +0900

Red Hat GFS is ...

The first native 64-bit cluster file system on Linux for enterprise workloads - support for x86, AMD64/EM64T, and Itanium
The most scalable enterprise cluster file system on Linux - supporting over 100 nodes
Tightly integrated with Red Hat Enterprise Linux (tracks kernel releases and is supported for the full lifetime)
The first open source (GPL) cluster file system for enterprise workloads
Fully POSIX-compliant, meaning applications don't have to be rewritten to use GFS

Red Hat GFS is commonly used in clusters of enterprise applications to provide high speed access to a consistent file system image across the server nodes. This allows the cluster nodes to simultaneously read and write to a single shared filesystem. Typical application clusters where Red Hat GFS is deployed today include:

Databases - View the install guide for Oracle RAC
Application and web servers
In-house custom applications
High-performance compute clusters where NFS scalability and performance are key

Red Hat Global File System (GFS) is supported for use with Red Hat Enterprise Linux AS, Red Hat Enterprise Linux WS, and Red Hat Enterprise Linux ES on x86, AMD64/EM64T and Itanium. Like all Red Hat solutions, it is delivered through Red Hat Network on an annual subscription basis.

개요

GFS가 구축된 후의 모습은 대략 이렇게 됩니다.

Conga를 이용하여 GFS시스템 구축하기

conga는 Redhat에서 제공하는 클러스터링 관리 툴입니다. 클러스터링을 편리하게 구축하고 관리하기위한 다양한 기능들이 내장되어있습니다. 또한 웹 인터페이스를 기본으로 하기 때문에 셸로 접속할 필요없이 언제 어디서든 웹으로 접속하여 편리하고 관리할 수 있습니다.

CentOS 5.2부터 패키지형식으로 제공되고 있어 편리하게 설치할 수 있습니다. 패키지를 설치하기 전에 다음의 사항을 미리 생각해보아야 합니다.

conga 프로그램이 설치될 호스트 : GFS를 제공하는 노드와 겸해도 상관없음.
GFS를 구성할 때 디스크를 제공하는 노드
GFS 파티션을 외부로 NFS로 제공할 노드
conga 프로그램과 각 노드가 통신할 포트

conga 패키지 설치

먼저 GFS가 설치될 모든 노드에 conga패키지를 설치합니다.

yum install ricci

의존성에 따라 부가적으로 추가로 설치되는 패키지가 있을 수 있으니 같이 설치해줍니다.

[root@localhost ~]# yum install ricci
Loading "fastestmirror" plugin
Loading mirror speeds from cached hostfile
* base: centos.mirror.cdnetworks.com
* updates: centos.mirror.cdnetworks.com
* addons: centos.mirror.cdnetworks.com
* extras: centos.mirror.cdnetworks.com
Setting up Install Process
Parsing package install arguments
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package ricci.i386 0:0.12.0-7.el5.centos.3 set to be updated
--> Processing Dependency: modcluster >= 0.10.0 for package: ricci
--> Running transaction check
---> Package modcluster.i386 0:0.12.0-7.el5.centos set to be updated
--> Processing Dependency: libcman.so.2 for package: modcluster
--> Running transaction check
---> Package cman.i386 0:2.0.84-2.el5 set to be updated
--> Processing Dependency: perl(XML::LibXML) for package: cman
--> Processing Dependency: openais for package: cman
--> Processing Dependency: libcpg.so.2(OPENAIS_CPG_1.0) for package: cman
--> Processing Dependency: libSaCkpt.so.2 for package: cman
--> Processing Dependency: libSaCkpt.so.2(OPENAIS_CKPT_B.01.01) for package: cman
--> Processing Dependency: libcpg.so.2 for package: cman
--> Processing Dependency: perl(Net::Telnet) for package: cman
--> Running transaction check
---> Package openais.i386 0:0.80.3-15.el5 set to be updated
---> Package perl-XML-LibXML.i386 0:1.58-5 set to be updated
--> Processing Dependency: perl(XML::SAX::DocumentLocator) for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl(XML::SAX::Base) for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl-XML-SAX for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl(XML::SAX::Exception) for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl-XML-LibXML-Common for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl(XML::LibXML::Common) for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl(XML::NamespaceSupport) for package: perl-XML-LibXML
--> Processing Dependency: perl-XML-NamespaceSupport for package: perl-XML-LibXML
---> Package perl-Net-Telnet.noarch 0:3.03-5 set to be updated
--> Running transaction check
---> Package perl-XML-NamespaceSupport.noarch 0:1.09-1.2.1 set to be updated
---> Package perl-XML-SAX.noarch 0:0.14-5 set to be updated
---> Package perl-XML-LibXML-Common.i386 0:0.13-8.2.2 set to be updated
--> Finished Dependency Resolution
Dependencies Resolved
=============================================================================
Package                 Arch       Version          Repository        Size
=============================================================================
Installing:
ricci                   i386       0.12.0-7.el5.centos.3 base              1.1 M
Installing for dependencies:
cman                    i386       2.0.84-2.el5     base              595 k
modcluster              i386       0.12.0-7.el5.centos base              336 k
openais                 i386       0.80.3-15.el5    base              368 k
perl-Net-Telnet         noarch     3.03-5           base               56 k
perl-XML-LibXML         i386       1.58-5           base              231 k
perl-XML-LibXML-Common i386       0.13-8.2.2       base               16 k
perl-XML-NamespaceSupport noarch     1.09-1.2.1       base               15 k
perl-XML-SAX            noarch     0.14-5           base               75 k
Transaction Summary
=============================================================================
Install      9 Package(s)
Update       0 Package(s)
Remove       0 Package(s)
Total download size: 2.7 M
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
(1/9): perl-XML-LibXML-Co 100% |=========================| 16 kB    00:00
(2/9): perl-XML-SAX-0.14- 100% |=========================| 75 kB    00:00
(3/9): perl-Net-Telnet-3. 100% |=========================| 56 kB    00:00
(4/9): perl-XML-Namespace 100% |=========================| 15 kB    00:00
(5/9): ricci-0.12.0-7.el5 100% |=========================| 1.1 MB    00:00
(6/9): perl-XML-LibXML-1. 100% |=========================| 231 kB    00:00
(7/9): modcluster-0.12.0- 100% |=========================| 336 kB    00:00
(8/9): openais-0.80.3-15. 100% |=========================| 368 kB    00:00
(9/9): cman-2.0.84-2.el5. 100% |=========================| 595 kB    00:00
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Finished Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
Installing: perl-XML-NamespaceSupport    ######################### [1/9]
Installing: perl-XML-SAX                 ######################### [2/9]
Installing: perl-XML-LibXML-Common       ######################### [3/9]
Installing: perl-XML-LibXML              ######################### [4/9]
could not find ParserDetails.ini in /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/XML/SAX
Installing: perl-Net-Telnet              ######################### [5/9]
Installing: openais                      ######################### [6/9]
Installing: cman                         ######################### [7/9]
Installing: modcluster                   ######################### [8/9]
Installing: ricci                        ######################### [9/9]
Installed: ricci.i386 0:0.12.0-7.el5.centos.3
Dependency Installed: cman.i386 0:2.0.84-2.el5 modcluster.i386 0:0.12.0-7.el5.centos openais.i386 0:0.80.3-15.el5 perl-Net-Telnet.noarch 0:3.03-5 perl-XML-LibXML.i386 0:1.58-5 perl-XML-LibXML-Common.i386 0:0.13-8.2.2 perl-XML-NamespaceSupport.noarch 0:1.09-1.2.1 perl-XML-SAX.noarch 0:0.14-5
Complete!
[root@localhost ~]#

[root@localhost ~]# service ricci start
Starting oddjobd: [ OK ]
Starting ricci: [ OK ]
[root@localhost ~]#

conga 호스트 컴퓨터에 conga서버 패키지인 luci를 설치합니다.

[root@localhost ~]# yum install luci
Loading "fastestmirror" plugin
Loading mirror speeds from cached hostfile
* base: centos.mirror.cdnetworks.com
* updates: centos.mirror.cdnetworks.com
* addons: centos.mirror.cdnetworks.com
* extras: centos.mirror.cdnetworks.com
Setting up Install Process
Parsing package install arguments
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package luci.i386 0:0.12.0-7.el5.centos.3 set to be updated
--> Processing Dependency: python-imaging for package: luci
--> Running transaction check
---> Package python-imaging.i386 0:1.1.5-5.el5 set to be updated
--> Processing Dependency: libtk8.4.so for package: python-imaging
--> Processing Dependency: tkinter for package: python-imaging
--> Running transaction check
---> Package tkinter.i386 0:2.4.3-21.el5 set to be updated
--> Processing Dependency: libTix8.4.so for package: tkinter
---> Package tk.i386 0:8.4.13-5.el5_1.1 set to be updated
--> Running transaction check
---> Package tix.i386 1:8.4.0-11.fc6 set to be updated
--> Finished Dependency Resolution
Dependencies Resolved
=============================================================================
Package                 Arch       Version          Repository        Size
=============================================================================
Installing:
luci                    i386       0.12.0-7.el5.centos.3 base               27 M
Installing for dependencies:
python-imaging          i386       1.1.5-5.el5      base              410 k
tix                     i386       1:8.4.0-11.fc6   base              329 k
tk                      i386       8.4.13-5.el5_1.1 base              888 k
tkinter                 i386       2.4.3-21.el5     base              279 k
Transaction Summary
=============================================================================
Install      5 Package(s)
Update       0 Package(s)
Remove       0 Package(s)
Total download size: 28 M
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
(1/5): python-imaging-1.1 100% |=========================| 410 kB    00:00
(2/5): tk-8.4.13-5.el5_1. 100% |=========================| 888 kB    00:00
(3/5): tix-8.4.0-11.fc6.i 100% |=========================| 329 kB    00:00
(4/5): luci-0.12.0-7.el5. 100% |=========================| 27 MB    00:02
(5/5): tkinter-2.4.3-21.e 100% |=========================| 279 kB    00:00
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Finished Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
Installing: tk                           ######################### [1/5]
Installing: tix                          ######################### [2/5]
Installing: tkinter                      ######################### [3/5]
Installing: python-imaging               ######################### [4/5]
Installing: luci                         ######################### [5/5]
Installed: luci.i386 0:0.12.0-7.el5.centos.3
Dependency Installed: python-imaging.i386 0:1.1.5-5.el5 tix.i386 1:8.4.0-11.fc6 tk.i386 0:8.4.13-5.el5_1.1 tkinter.i386 0:2.4.3-21.el5
Complete!
[root@localhost ~]#

의존성에 따라 부가적으로 추가로 설치되는 패키지가 있을 수 있으니 같이 설치해줍니다.

이제 luci을 사용하기 위해 초기화를 해야합니다.

[root@localhost ~]# luci_admin init
Initializing the luci server
Creating the 'admin' user
Enter password:
Confirm password:
Please wait...
The admin password has been successfully set.
Generating SSL certificates...
The luci server has been successfully initialized
You must restart the luci server for changes to take effect.
Run "service luci restart" to do so
[root@localhost ~]#

관리용 비밀번호를 생성합니다.

모든 작업이 완료되었으면 luci를 재시작합니다.

[root@localhost ~]# service luci restart
Shutting down luci: [ OK ]
Starting luci: Generating https SSL certificates... done
[ OK ]
Point your web browser to https://localhost:8084 to access luci
[root@localhost ~]#

이제 https://hostname:8084/ 주소로 luci에 접속하여 클러스터링은 관리할 수 있습니다.

luci를 이용하여 GFS구성

luci를 이용하기 앞서, 아직 luci가 조금 불안한 면을 보인다는 점을 말씀드리고 싶습니다. 설정이 적용이 잘 안되거나, 엉뚱하게 설정되거나 하는 일들이 간혹 발생합니다. 그럴 경우에는 패키지(ricci, luci)를 삭제하시고 /etc/cluster 디렉토리를 삭제 하신 후 다시 패키지 설치부터 다시 진행해보시길 바랍니다.

luci 접속

웹 브라우져에 https://hostname:8084 를 입력하면 luci에 접속할 수 있습니다.

클러스터 노드 구성

로그인 후 맨 위에 cluster 탭을 선택하고 좌측 Create New Cluster를 선택합니다. 클러스터 시스템을 추가할 수 있는 화면이 나옵니다. 알맞은 내용을 써 넣습니다.

Cluster Name : 클러스터 이름
Node Hostname : 각 노드의 호스트 이름. 보통 /etc/hosts 에 정의된 이름을 적어주면 되며, 호스트이름은 '.' 문자가 들어가야 제대로 작동함(예 : gfs01.test). IP주소를 적으면 불안한 경향이 있음.
Root Password : 각 노드에 접속할 때 사용할 root 비밀번호
Add a cluster node : 노드를 입력할 공란을 한개 추가함.
Download packages : 추가로 필요한 패키지를 내려받아 사용함.
Use locally installed packages. : 이미 설치된 패키지를 사용함.

Submit를 누르면 클러스터 구성이 자동으로 진행됩니다.

설치 과정에 따라 오랜 시간이 걸릴 수 있습니다. 각 단계가 지날 때마다 그래프로 표시가 되며 클러스터 구성이 완료되면 구성한 클러스터 정보 화면을 볼 수 있습니다.

왼쪽 메뉴를 보면 방금 설정한 클러스터가 메뉴에 추가된 것을 볼 수 있습니다. Nodes를 선택하여 현재 노드 상태를 확인해봅니다.

각 노드들의 상태(Status)가 Cluster Member로 되어있으면 구성이 잘 되어 동작하고 있는 상태입니다.

현재 상태가 Cluster Member로 되어있지 않은 경우에는,

오른쪽 Choose a Task...를 눌러 have node join a cluster를 선택하거나
직접 노드에 접속하여 # service cman restart 를 실행하여 서비스를 재시작해봅니다.

luci에 접속하지 않고도 clustat 명령을 사용하여 현재 클러스터 상태를 확인할 수 있습니다.

모두 Online으로 표시되어야 정상입니다.

[root@gs002 ~]# clustat
Cluster Status for 40-storage @ Thu Oct 2 02:10:51 2008
Member Status: Quorate
Member Name                             ID   Status
------ ----                             ---- ------
gs002.gfs                                   1 Online, Local
grand.gfs                                   2 Online
ridicule.gfs                                3 Online
[root@gs002 ~]#

GFS구성

하나의 큰 스토리지를 구성하여 사용하려면 Logical Volume을 구성하는 것도 좋은 방법입니다.

GFS를 이용하여 각 노드에 있는 원격의 파티션을 끌어와 Logical Volume으로 하나의 큰 파티션을 만들 것입니다.

이 과정에서 GNBD가 필요하게 됩니다. GNBD를 통하여 로컬 노드의 파티션을 외부에 보이고, 원격 노드의 파티션을 가져와 사용할 수 있습니다.

GNBD설치

gnbd관련 패키지를 설치합니다. gnbd프로그램과 커널 모듈을 설치하여야 합니다.

kmod로 시작하는 커널 모듈은 PAE, XEN 등 커널의 종류에 따라 모듈을 다르게 설치하여야 합니다.

[root@localhost ~]# yum install gnbd kmod-gnbd
Loading "fastestmirror" plugin
Loading mirror speeds from cached hostfile
* base: centos.mirror.cdnetworks.com
* updates: centos.mirror.cdnetworks.com
* addons: centos.mirror.cdnetworks.com
* extras: centos.mirror.cdnetworks.com
Setting up Install Process
Parsing package install arguments
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package kmod-gnbd.i686 0:0.1.4-12.el5 set to be installed
---> Package gnbd.i386 0:1.1.5-1.el5 set to be updated
--> Finished Dependency Resolution
Dependencies Resolved
=============================================================================
Package                 Arch       Version          Repository        Size
=============================================================================
Installing:
gnbd                    i386       1.1.5-1.el5      base               84 k
kmod-gnbd               i686       0.1.4-12.el5     base               14 k
Transaction Summary
=============================================================================
Install      2 Package(s)
Update       0 Package(s)
Remove       0 Package(s)
Total download size: 98 k
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
(1/2): gnbd-1.1.5-1.el5.i 100% |=========================| 84 kB    00:00
(2/2): kmod-gnbd-0.1.4-12 100% |=========================| 14 kB    00:00
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Finished Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
Installing: gnbd                         ######################### [1/2]
Installing: kmod-gnbd                    ######################### [2/2]
Installed: gnbd.i386 0:1.1.5-1.el5 kmod-gnbd.i686 0:0.1.4-12.el5
Complete!
[root@localhost ~]#

GNBD구성

GNBD를 구성하기 전에 GNBD모듈이 로딩되었는지, 클러스터 구성이 제대로 되어있는지 꼭 확인하여야합니다.

GNBD export

GNBD를 이용하여 원하는 장치를 외부로 노출 시킬 수 있습니다.

GNBD서버를 시작합니다.

[root@gfs01 ~]# gnbd_serv -v
gnbd_serv: startup succeeded

여기서는 하나의 하드디스크 전체(/dev/sdb)를 통째로 사용하겠습니다. 명령어는 gnbd_export를 사용합니다. 사용되는 옵션은 다음과 같습니다.

-d : 외부로 노출할 장치 혹은 디스크 파티션
-e : gnbd에서 인식할 장치 이름

[root@gfs01 ~]# gnbd_export -d /dev/sdb -e gfs01_sdb -v
gnbd_clusterd: connected
gnbd_export: created GNBD gfs01_sdb serving file /dev/sdb

다음과 같이 결과를 확인할 수 있습니다.

[root@gfs01 ~]# gnbd_export -l
Server[1] : gfs01_sdb
--------------------------
      file : /dev/sdb
   sectors : 209715200
readonly : no
    cached : no
   timeout : 60
[root@gfs01 ~]#

GFS에 디스크를 제공할 각 노드에서 위의 과정을 모두 적용합니다.

GNBD import

GNBD를 이용하여 외부로 노출한 장치를 가져와서 로컬디스크인 것 처럼 사용합니다.

GNBD서버를 시작합니다.

[root@localhost ~]# gnbd_serv -v
gnbd_serv: startup succeeded

gnbd_import 명령을 사용하여 외부의 장치를 가져올 수 있습니다.

-i : 가져올 호스트 주소를 적어주면 모든 장치를 가져옴.

[root@ridicule gnbd]# gnbd_import -i grand.gfs
gnbd_import: created gnbd device grand_sda
gnbd_monitor: gnbd_monitor started. Monitoring device #0
gnbd_recvd: gnbd_recvd started
[root@ridicule gnbd]#

방금 전 외부로 노출했던 모든 노드들에 대하여 이를 반복합니다.

디렉토리 /dev/gnbd 를 살펴보면 현재 import된 장치를 확인할 수 있습니다.

[root@ridicule gnbd]# ls -al /dev/gnbd/
total 0
drwxr-xr-x 2 root root 80 Oct 3 02:09 .
drwxr-xr-x 13 root root 6040 Oct 3 01:48 ..
brw-r--r-- 1 root root 252, 0 Oct 3 02:09 grand_sda
brw-r--r-- 1 root root 252, 1 Oct 3 02:09 gs002_sda
[root@ridicule gnbd]#

LVM설정

가져온 장치를 이용하여 LVM을 구성합니다.

장치를 구성하는 순서는 다음과 같습니다.

Physical Volume(pv)
Volume Group(vg)
Logical Volume(lv)

기본적인 명령은 create, remove, display, scan 등이 있으며 [pv/vg/lv]create 등으로 사용하시면 됩니다.

각 장치를 모두 pv로 등록합니다.

[root@ridicule /]# pvcreate /dev/gnbd/grand_sda
Physical volume "/dev/gnbd/grand_sda" successfully created
[root@ridicule /]# pvcreate /dev/gnbd/grand_sda
Physical volume "/dev/gnbd/grand_sda" successfully created
[root@ridicule /]#

pvdisplay 명령으로 확인할 수 있습니다.

[root@ridicule /]# pvdisplay
"/dev/gnbd0" is a new physical volume of "3.64 TB"
--- NEW Physical volume ---
PV Name               /dev/gnbd0
VG Name
PV Size               3.64 TB
Allocatable           NO
PE Size (KByte)       0
Total PE              0
Free PE               0
Allocated PE          0
PV UUID               RbLAwv-FmlE-uMJX-XNVe-SmrR-0vaT-t64FxW
"/dev/gnbd1" is a new physical volume of "2.73 TB"
--- NEW Physical volume ---
PV Name               /dev/gnbd1
VG Name
PV Size               2.73 TB
Allocatable           NO
PE Size (KByte)       0
Total PE              0
Free PE               0
Allocated PE          0
PV UUID               cpv9wJ-hOHb-tRUt-RD3C-e2X0-LTap-msLuF7
[root@ridicule /]#

만들어진 pv을 이용해 vg를 만듭니다.

[root@ridicule /]# vgcreate storage /dev/gnbd/gs002_sda /dev/gnbd/grand_sda
Volume group "storage" successfully created
[root@ridicule /]#

vgdisplay명령으로 확인할 수 있습니다.

[root@ridicule /]# vgdisplay
--- Volume group ---
VG Name               storage
System ID
Format                lvm2
Metadata Areas        2
Metadata Sequence No 1
VG Access             read/write
VG Status             resizable
MAX LV                0
Cur LV                0
Open LV               0
Max PV                0
Cur PV                2
Act PV                2
VG Size               6.37 TB
PE Size               4.00 MB
Total PE              1668910
Alloc PE / Size       0 / 0
Free PE / Size       1668910 / 6.37 TB
VG UUID               Ka8FBa-7Vdr-WusA-OTTz-edJc-bEd4-hZxjEU
[root@ridicule /]#

lvcreate명령을 이용하여 lv를 만듭니다.

-L : 용량을 지정
-n : lv의 이름을 지정

[root@ridicule /]# lvcreate -L 6T -n storage01 storage
Logical volume "storage01" created
[root@ridicule /]#

생성된 lv를 최종적으로 GFS2로 포맷합니다.

[root@ridicule /]# mkfs.gfs2 -p lock_dlm -t storage-cluster:storage01 -j 4 /dev/storage/storage01

이를 마운트 하면 모든 과정이 끝나고 사용할 수 있는 상태가 됩니다.

lanai-gcc 설치

Thu, 11 Sep 2008 17:35:47 +0900

gcc34 를 이용

icc

Thu, 11 Sep 2008 15:57:03 +0900

http://support.intel.com/support/performancetools/c/linux/

http://support.intel.com/support/performancetools/fortran/linux/

Streaming SIMD Extensions 2(SSE2)
-xN : Pentium 4 or Xeon
-f77rtl

"Failed dependencies: libstdc++.so.5(CXXABI_1.2)is needed by Opera
libstdc++.so.5(GLIBCPP_3.2) is needed by

libstdc++.so.5(GLIBCPP_3.2) : yum install compat-libstdc++-33

./install.sh
1. Install
1. Provide your serial number
enter the serial
unsupported install of this product : yes
1. Typical Install
Lisence 화면 : accept
Lisence 화면 : accept
설치 경로
설치 설치

CentOS 5.2 의 경우

./data/install_cc.sh

IS_OS_REDHAT_EL_5()를 찾아

RELEASE_CONTENT_A, B를 수정하여 줌.

navisphere

칼로리사전

필립 퍼키스의 사진강의 노트

책

사진을 어떻게 찍을 것인가 HOW TO TAKE A PICTURE

사진과 시 PHOTOGRAPHY AND POETRY

사진, 서구문명 몰락의 원인 PHOTOGRAPHY AS THE CAUSE OF THE DOWNFALL OF WESTERN CIVILIZATION

보는 방법 HOW TO LOOK

의도 INTENTION

풍경 LANDSCAPE

디지털 사진에 대한 재고 DIGITAL REVISITED

니오타니 NEOTENY

LoadLeveler

LoadLeveler

DNA_snaps_with_solvent

필요한 라이브러리 준비#

CLAPACK#

make 환경 파일을 복사#

make f2c#

make blas#

blas test#

make CLAPACK#

ATLAS#

configure#

make#

f2c#

프로그램 설치#

GFS

Red Hat GFS is ...

개요

Conga를 이용하여 GFS시스템 구축하기

conga 패키지 설치

luci를 이용하여 GFS구성

luci 접속

클러스터 노드 구성

GFS구성

GNBD설치

GNBD구성

GNBD export

GNBD import

LVM설정

lanai-gcc 설치

icc

필요한 라이브러리 준비^#

CLAPACK^#

make 환경 파일을 복사^#

make f2c^#

make blas^#

blas test^#

make CLAPACK^#

ATLAS^#

configure^#

make^#

f2c^#

프로그램 설치^#